Temario.
La revisión de los contenidos se llevará a cabo en 4 dÃas.
DÃa 1. Introducción a la Secuenciación Masiva y UNIX
Iniciaremos con una revisión de las últimas metodologÃas de Secuenciación Masiva de ADN.
Continuaremos con una revisión de comando de linux y tuberÃas. (Se espera que los participantes tengan ya experiencia en sistema operativo en lÃnea de comandos) Terminaremos con cunsultas a NCBI
Ponente: Jerome Verleyen
DÃa 2. Introducción al Ensamblado de Genomas
Introducción a los conceptos básicos de reconstrucción de secuencias y revisión de herramientas para llevar a cabo un ensamblado de Novo.
Ponente: Alejandro Sánchez
DÃa 3. Evaluación de Ensambles
Iniciaremos realizando alineamientos de Secuencias vs. Ensambles
Revisaremos las estadÃsticas que determinan la calidad de un ensamble.
DÃa 4. Expresión Diferencial
Para concluir el curso, se realizará un ensamble de un transcriptoma de novo con anotación. Analizaremos métodos como Trinity y DEseq